Gelred核酸凝膠染料/核酸染料
Gelred核酸凝膠染料/核酸染料
zui靈敏 , zui穩(wěn)定的核酸凝膠染色試劑,是真正的EB替代產品!
由美國BIOTIUM公司技術專家研發(fā)的GelRed 和GelGreen 是兩種集高靈敏、低毒性和超穩(wěn)定于一身的的熒光核酸凝膠染色試劑。其水溶染色劑通過美國*安全認定,廢棄物可直接倒入下水道,而不會造成任何環(huán)境污染。
目前大多數(shù)商業(yè)化的核酸染料(凝膠染色試劑)總是在安全性、穩(wěn)定性和靈敏性等方面不*令人滿意。例如,雖然 EB (溴化乙啶)作為目前使用zui廣泛的核酸凝膠染色試劑,能夠在多數(shù)應用中提供可以接受的靈敏度,但它是一種高誘變性的化學物質。而且EB染色后具有較高的背景熒光信號(如圖1)。 SYBR Green I 和 SYBR Gold 也被廠家宣傳為zui靈敏的凝膠染色試劑。但 SYBR Green I 尤其是 SYBR Gold 在常用的微堿性電泳緩沖溶液或預制凝膠中會快速降解,穩(wěn)定性差導致染色效果極不可靠。 SYBR safe 被認為是市場上較為安全的核酸染料 ,但它的染色效果還遠不及 SYBR Green I 。
至于國內有公司宣稱的新產品Goldview,我們不想多加評論。因為從極為相似的對比試驗結果來看,該產品似乎就是AO(丫啶橙 ,一種judu產品,且熒光亮度不佳)。
GelRed核酸染料特性:
高靈敏度
GelRed 和 GelGreen 是目前市場中zui靈敏的凝膠核酸染料
穩(wěn)定性*
可以使用微波爐加熱,可以在室溫下保存
更安全
艾姆斯氏試驗結果表明,該染料的誘變性遠小于 溴化乙錠 ( EB )
廣泛的適應性
適用于預制凝膠和凝膠電泳后染色
染色過程簡單
與 EB 一樣,在預制膠和電泳過程中不必擔心染料降解;而電泳后染色過程也只需 30 分鐘且無需脫色或沖洗
對 DNA 和 RNA 的遷移影響極小
對核酸遷移的影響小于 SYBR Green I
與標準凝膠成像系統(tǒng)以及可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置完美兼容
使用 312nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)時, GelRed 可以完美的替代 EB ;使用 254nm 激發(fā)的 UV 凝膠成像系統(tǒng)或可見光激發(fā)的凝膠觀察裝置時, GelGreen 足以替代任意一種 SYBR 染料(見圖 4 中的光譜圖)
Biotium公司的GelRed 和 GelGreen 無論用于預制凝膠染色還是凝膠電泳后染色,都表現(xiàn)出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統(tǒng)而設計的 GelRed ,在使用了我們新開發(fā)的具有的試驗步驟后(該試驗步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統(tǒng)的 TBE 緩沖溶液),在凝膠電泳后染色中優(yōu)于或者至少相當于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同, GelRed 在預制凝膠中使用時仍然有*的靈敏度,事實上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現(xiàn)出更高的靈敏度,尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏(圖1)。 GelGreen 可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發(fā)的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當,但不存在后者的不穩(wěn)定性問題。實際上, GelRed 和 GelGreen ,特別是 GelRed 非常穩(wěn)定,可以*在室溫下保存。當這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時甚至可以使用微波爐加熱,便于采用常規(guī)方法制備預制凝膠。含有染料的預制凝膠可以成批制備,*保存。
同樣重要的是, GelRed 和 GelGreen 相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。獨立的測試服務公司( Litron Laboratories, Inc. )進行的標準艾姆斯氏測試結果表明, 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠高于*用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液)濃度下, GelGreen 沒有誘變性,而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學結構使其難以穿透細胞膜進入細胞,正是這一特性降低了染料的細胞毒性。如圖3。相反, SYBR Green I 廣泛地用于活細胞線粒體和核 DNA 染色,這正是由于它能快速的被細胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導致的突變有強烈的增強作用( Ohta et al. Mutat. Res. 492 , 91(2001) ),因此它的高細胞膜透性使它在紫外環(huán)境觀察時成為凝膠染色的主要有害物質。