Neosuite CNPD 中國天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫 (Chinese Natural Product Database, NeoSuite)     

     Neosuite CNPD 中國天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫 [Chinese Natural Product Database (CNPD^TM)] 是創(chuàng)騰科技有限公司和*上海藥物研究所聯(lián)合開發(fā)的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫。這一數(shù)據(jù)庫是在 ISIS 化學(xué)信息管理系統(tǒng)的基礎(chǔ)上建立并完成的。ISIS 化學(xué)信息管理系統(tǒng)是目前通用的管理系統(tǒng)，使用方便, 兼容性好。

     CNPD^TM 是面向相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)家建立的易于使用的綜合性天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)，該產(chǎn)品力圖系統(tǒng)的收集、整理、分析從中國國產(chǎn)的植物中分離鑒定出的天然產(chǎn)物的物理性質(zhì)、生物活性及化學(xué)結(jié)構(gòu)等信息，結(jié)合中國傳統(tǒng)中草藥的應(yīng)用實(shí)踐，利用*的計算機(jī)化學(xué)信息管理手段，為中國的新藥、天然產(chǎn)物及相關(guān)領(lǐng)域的研究與開發(fā)工作，提供一個*的好工具。

CNPD^TM——物有所值的天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫

     CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫包括兩方面內(nèi)容：一是庫管理系統(tǒng)，二是數(shù)據(jù)本身。

    CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫的一個重要方面是管理系統(tǒng)。CNPD^TM 的數(shù)據(jù)庫是利用*的化學(xué)信息管理系統(tǒng) ISIS/Base & Draw 進(jìn)行數(shù)據(jù)管理，可以方便地連接其他應(yīng)用系統(tǒng)如 BIOVIA 所提供的分子模擬和分子設(shè)計軟件系統(tǒng) Discovery Studio。 ISIS/Base & Draw 在 Windows 環(huán)境下運(yùn)行，使用者無需任何專業(yè)計算機(jī)知識 , 不需學(xué)習(xí)任何編程語言 , 即可利用 ISIS/Base & Draw 對 CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫自如地進(jìn)行檢索、瀏覽和維護(hù)。更重要的是，使用者在使用 ISIS/Base & Draw 對 CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索時，還可以使用到一種非常有效的新功能結(jié)構(gòu)式搜尋?；瘜W(xué)結(jié)構(gòu)式是化學(xué)家的通用語言，當(dāng)化學(xué)家利用結(jié)構(gòu)式搜尋功能對 CNPD^TM數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索時， 可以非常準(zhǔn)確的得到他們所需的信息。

     CNPD^TM 數(shù)據(jù)庫的另一個重要內(nèi)容便是數(shù)據(jù)本身。CNPD^TM 目前共收集了五萬七千多個天然產(chǎn)物，涵蓋天然產(chǎn)物的三十七個類別。而且類藥性分析結(jié)果標(biāo)明，CNPD^TM 中有 70％的分子是類藥性分子。

     同時 CNPD^TM 還收集了天然產(chǎn)物相關(guān)的各類信息，主要包括：

• 天然產(chǎn)物的二維分子結(jié)構(gòu)及三維分子結(jié)構(gòu)。三維分子結(jié)構(gòu)是利用分子力學(xué)方法優(yōu)化得到的。導(dǎo)出的三維分子結(jié)構(gòu)不僅可以進(jìn)行針對藥物靶標(biāo)的虛擬篩選，而且可以將三維分子結(jié)構(gòu)與生物活性資料相結(jié)合，來探索分子結(jié)構(gòu)和活性間的相互關(guān)系。

•  天然產(chǎn)物的名稱、分子式、分子量、熔點(diǎn)、旋光度等重要理化性質(zhì)。

•  天然產(chǎn)物的 CAS 登錄號。CAS 登錄號可以作為與其它化學(xué)信息資源關(guān)聯(lián)的便捷接口。

•  一些天然產(chǎn)物的生物活性信息及其參考文獻(xiàn)。包括文獻(xiàn)來源、作者、年代等詳細(xì)信息。

•  天然產(chǎn)物的自然來源及其參考文獻(xiàn)。包括文獻(xiàn)來源、作者、年代等詳細(xì)信息。

•  原植物或其同屬中藥在中國傳統(tǒng)醫(yī)藥中的應(yīng)用。包括中文名，拉丁文名，性味，歸經(jīng)及功用主治等。

CNPD^TM 的應(yīng)用
     CNPD^TM 可以為從事藥物化學(xué)、植物化學(xué)、有機(jī)化學(xué)、醫(yī)藥、農(nóng)藥及生物化學(xué)等領(lǐng)域的研究人員提供有益的幫助，例如：
• 幫助研究人員系統(tǒng)的了解天然產(chǎn)物分離、提取和鑒定的研究方法。
• 對天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)及生物活性信息進(jìn)行定量或定性的分析研究，深入了解某類藥物的結(jié)構(gòu)與活性之間的關(guān)系, 為新藥研究提供系統(tǒng)的和有價值的信息。
• 通過虛擬篩選方法篩選天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫CNPD^TM 也是獲得先導(dǎo)化合物或活性化合物的一條有效途徑。
• 由于天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)具有非常好的差異性, 因此天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫中的許多化合物可以作為組合化學(xué)庫設(shè)計的起始結(jié)構(gòu)。
• CNPD^TM *將天然產(chǎn)物、生物活性數(shù)據(jù)、原植物來源及中藥傳統(tǒng)應(yīng)用融合在一起，并且提供三維結(jié)構(gòu)信息，所以它可以幫助科研人員充分了解中國天然產(chǎn)物資源。
     因此，在中國的新藥、天然產(chǎn)物及相關(guān)領(lǐng)域的研究與開發(fā)工作中，CNPD^TM 是一個*的好工具。

升級/ 補(bǔ)充
     中國科學(xué)家在對天然產(chǎn)物及中草藥的研究中積累了大量的信息資源。CNPDTM 將通過版本升級來充實(shí)和完善數(shù)據(jù)庫，包括新條目的補(bǔ)充以及條目內(nèi)容的增加、更新等。新版的CNPDTM 中還增加用于虛擬篩選的三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫，為用戶在使用其他的分子模擬和設(shè)計軟件系統(tǒng)方面提供更多的方便。