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更新時(shí)間:2019-10-28 12:45:55瀏覽次數(shù):1077
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Bioactivity Databases 生物活性數(shù)據(jù)庫(kù)包括:藥物數(shù)據(jù)報(bào)道數(shù)據(jù)庫(kù) (ACCELRYS Drug Data Report, MDDR) ,綜合藥物化學(xué)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù) (Comprehensive Medicinal Chemistry-3D) 。代謝、毒性數(shù)據(jù)庫(kù) Metabolite 和 Toxicity 。
Bioactivity Databases 生物活性數(shù)據(jù)庫(kù)
Accelrys藥物數(shù)據(jù)報(bào)道數(shù)據(jù)庫(kù) (MDL Drug Data Report,MDDR) :作為 Prous Drug Data Report 的電子版本,MDDR 包括了大約 233,000 種候選藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)及 3D 模型、生物活性、專li和版權(quán)信息及參考文獻(xiàn)等。這些候選藥物或已成藥,或處于臨床研究期間。在每月公布的專li中,新的具有生物活性的化合物都加入到數(shù)據(jù)庫(kù)中,并且追蹤臨床試驗(yàn)的進(jìn)展。作為當(dāng)前的一種掌握信息的工具,MDDR 在了解醫(yī)藥工業(yè)發(fā)展、追蹤競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的研究進(jìn)展方面很有價(jià)值;作為一種研究手段,它在確定結(jié)構(gòu)特征對(duì)特定的生物活性的影響方面,是一個(gè)*的選擇。
綜合藥物化學(xué)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù) (Comprehensive Medicinal Chemistry,CMC) :綜合藥物化學(xué)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)含有 9,500(1900 年至今)多種化合物,包括它們的二維結(jié)構(gòu)、三維模型以及重要的生化特征。所有這些化合物曾作為藥物試劑進(jìn)行過(guò)人體實(shí)驗(yàn)。它是根據(jù) Pergammon 出版的<<綜合藥物化學(xué)>>一書所載的信息發(fā)展而成的。數(shù)據(jù)包括藥物名稱同義詞、藥物分類、LogP 值和 pKa 值,還包括美國(guó)化學(xué)文摘社 (CAS) 登錄號(hào)和參考文獻(xiàn)。綜合藥物化學(xué)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中的藥物信息中不僅含有已知的和人們關(guān)注的生物活性,還能進(jìn)行基于結(jié)構(gòu)的計(jì)算以進(jìn)行構(gòu)效關(guān)系(SAR)的研究,從而使它成為一種在探索構(gòu)效關(guān)系 (SAR) 、預(yù)測(cè)和改進(jìn)藥效基團(tuán)特性等方面十分有用的工具。
代謝數(shù)據(jù)庫(kù) (Metabolite):代謝數(shù)據(jù)庫(kù)是一個(gè)完整的代謝信息系統(tǒng),其中包括衍生化合物代謝轉(zhuǎn)變過(guò)程的擴(kuò)展數(shù)據(jù)庫(kù)、檢索和顯示代謝過(guò)程的 Isentris 圖形化界面工具以及配套的登錄程序,該程序可將科研人員自身的專有研究加入系統(tǒng)。代謝數(shù)據(jù)庫(kù)包括了自 1901 年開始的研究,主要資料來(lái)自于 Pfeifer 和 Borchert 編著的<<藥物的生物轉(zhuǎn)化>>、<<藥代動(dòng)力學(xué)>>等著作。該庫(kù)把關(guān)于 68,200 種母體化合物、114,000 多個(gè)反應(yīng)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果綜合在一起,并劃分為多分支體系以便查看。數(shù)據(jù)庫(kù)包括了種類、藥物吸收和分泌途徑、分析方法學(xué)、母體化合物分類、sheng理活性、酶的信息、生物利用度等內(nèi)容。數(shù)據(jù)庫(kù)每六個(gè)月更新一次,資料的多少依賴于發(fā)表的研究數(shù)量,但通常每年大約有 3,000 條轉(zhuǎn)化信息加入到代謝數(shù)據(jù)庫(kù)之中。同時(shí),代謝庫(kù)還可與毒性數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)合使用,輕點(diǎn)鼠標(biāo)即可在化合物的毒性和代謝數(shù)據(jù)間靈活切換。
毒性數(shù)據(jù)庫(kù) (Toxicity) : 毒性數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋了現(xiàn)今報(bào)導(dǎo)過(guò)的化合物的毒性和毒理數(shù)據(jù),包括急毒、致畸、對(duì)皮膚和眼睛的刺激、致癌及多劑量效應(yīng)等體內(nèi)和體外的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。數(shù)據(jù)資源來(lái)自于美國(guó)國(guó)家職業(yè)安全和健康研究所(NIOSH)的化學(xué)物質(zhì)毒性作用登記數(shù)據(jù)庫(kù) (RTECS) 。這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中包括了超過(guò) 172,000 種化學(xué)物質(zhì),其中三分之二是藥物和有希望成藥的分子,其它的來(lái)自于其它領(lǐng)域,例如:農(nóng)業(yè)化學(xué)、石油化工、塑料制造業(yè)、香料和調(diào)味品、動(dòng)植物提取物、無(wú)機(jī)化合物和金屬有機(jī)化合物。
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